Porównanie parametrów DNA określanych metodą spektrometrii UV-Vis przy 2 mm i 10 mm drodze przechodzenia wiązki światła przez kuwetę

• Autorzy: Gryzińska M. , Strachecka A. , Borsuk G.

Warianty tytułu

EN

Comparison of DNA methods defined in UV-Vis spectrometry with a 2 mm and 10 mm light beam passing through the cuvette

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Większość danych pochodzących z piśmiennictwa prezentuje rutynowo dwa parametry dotyczące izolatów DNA, a mianowicie jego stężenie oraz zanieczyszczenie białkami. Bardzo ważnym parametrem często pomijanym w doniesieniach naukowych jest zanieczyszczenie próbek DNA odczynnikami do izolacji. Zanieczyszczenia te mogą hamować działanie polimerazy DNA i enzymów restrykcyjnych. W ocenie spektrofotometrycznej istotne znaczenie ma droga optyczna kuwety, ponieważ przy 10 mm nie zawsze możliwy jest pomiar badanych parametrów DNA. Celem pracy było określenie metodą spektroskopii UV-Vis parametrów DNA wyizolowanego za pomocą dwóch komercyjnych zestawów przy dwóch drogach przechodzenia wiązki światła przez kuwetę (2 mm i 10 mm) oraz względem dwóch różnych prób ślepych, tj. wody i buforu, w którym zostało zawieszone DNA.

EN

Most of the data in this literature presents two parameters that routinely isolate DNA, namely its concentration and level of protein contamination. A very important factor that is often overlooked in scientific reports is contamination of DNA samples with isolation reagents. These impurities can inhibit the activity of a DNA polymerase and restriction enzymes. When assessed spectrophotometrically the optical path of the cuvette is of great importance, because at 10 mm, it is not always possible to measure the parameters of DNA. The aim of this study was to determine the method of UV-Vis spectroscopy parameters for the DNA isolate using two commercial kits on two paths passing a beam of light through a cuvette (2 mm and 10 mm) and the two different blind tests of water and a buffer in which the DNA was suspended.

Słowa kluczowe

PL

DNA; spektrometria; A260/A280; A260/A230; A320

EN

DNA; spectrometry; A260/A280; A260/A230; A320

• Wydawca: Centralny Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Aparatury Badawczej i Dydaktycznej, COBRABiD sp. z.o.o
• Czasopismo: Aparatura Badawcza i Dydaktyczna
• Rocznik: 2013
• Tom: T. 18, nr 1
• Strony: 55--59
• Opis fizyczny: Bibliogr. 11 poz., tab.

Twórcy

autor

Gryzińska M.

• Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, Katedra Biologicznych Podstaw Produkcji Zwierzęcej

autor

Strachecka A.

• Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, Katedra Biologicznych Podstaw Produkcji Zwierzęcej

autor

Borsuk G.

• Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, Katedra Biologicznych Podstaw Produkcji Zwierzęcej

Bibliografia

• [1] Gruszczyńska J., Nowak Z., 2007, Wybrane techniki i metody analizy DNA. Warszawa, Wydawnic¬two SGGW, 14-25.
• [2] Rybczyńska M., Wybrane zagadnienia z biologii molekularnej. Poznań, Wydawnictwo Naukowe UM, 11-27, 2002.
• [3] Słomski R., Analiza DNA. Przykłady analiz DNA. Teoria i praktyka. Poznań Wydawnictwo UP, 2008.
• [4] www.eppendorf.com
• [5] Kaczanowska E., Gromysz Kałkowska K., Szubartowska E., Przegląd badań nad hematologią ptaków domowych. Przegląd Zoologiczny 1986, XXX, 3, 279-292.
• [6] Khosravinia H., Narasimha Murthy H.N., Thertha Parasad D., Pirany N., Optimizing factors influencing DNA extraction from fresh whole avian blood. 2007, African Journal of Biotechnology, 6, 481-486.
• [7] Boujtita N., Isolating Genomic DNA from Whole Blood, Thermo Fisher Scientific, 2008.
• [8] De Jimenez E., Gonzalez J.L., Dominguez J.L., Saloma E.S., Characterization of DNA from Differentiated Cells. Eur J Biochem, 1974, 45, 25-29.
• [9] Budzyńska A., Kaczmarek A., Gospodarek E., Diagnostyka molekularna bakteryjnych zakażeń krwi. Postępy Nauk Medycznych, 12, 2008, 828-833.
• [10] Couch J. A., Fritz P.J., Isolation of DNA from Plants High in Polyphenols, Plant Mol Biol Rep, 8(1), 1990, 8-12.
• [11] Davidson M.W., Griggs B.G., Boykin D.W., Wilson W.D., Molecular Structural Effects Involved in the Interaction of Quinolinemet hanolamines with DNA. Implications for Antimalarial Action, J of Med Chem, 1977, 20 (9), 1117-1122.