Identyfikacja modyfikacji posttranslacyjnych peptydów

• Autorzy: Hartmer R. , Lubeck M.
• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Nowatorski system tandemowej spektrometrii mas tandemowej spektrometrii mas (PTM Discovery System), oferuje użytkownikowi możliwość zastosowania dwóch różnych metod fragmentacji MS: CID (ang. – collision induced dissociation) oraz ETD (ang. – electron transfer dissociation), których wyniki doskonale się uzupełniają. Informacje uzyskane przy pomocy obu technik idealnie nadają się do analizy modyfikacji posttranslacyjnych (PTM) białek, np. fosforyzacji. Fragmentacja oparta na metodzie ETD, podobnie jak powszechnie znana metoda CID, pozwala na szybką identyfikację peptydów w połączeniu z technikami rozdziału online.

EN

A novel tandem mass spectrometry instrument (PTM Discovery System) offers the application of two different MS fragmentation techniques (i.e. collision induced dissociation, CID, and electron transfer dissociation, ETD) showing highly complementary fragmentation results. The information obtained from both techniques is ideally suited for the characterization of post translational modification (PTM), such as phosphorylation. ETD based fragmentation shows a similar short duty cycle as common CID, allowing fast peptide identification and characterization in combination with online separation techniques.

Słowa kluczowe

PL

peptydy; białka; pułapka jonowa; spektrometria mas; spektrometr masowy; MS; fragmentacja; ETD; PTM; CID

EN

peptides; proteins; ion trap; mass spectrometry; mass spectrometer; MS; fragmentation; ETD; PTM; CID

• Wydawca: ELAMED Media Group
• Czasopismo: Laboratorium - Przegląd Ogólnopolski
• Rocznik: 2006
• Tom: nr 8-9
• Strony: 46--48
• Opis fizyczny: Bibliogr. 3 poz.

Twórcy

autor

Hartmer R.

• Bruker Daltonik GmbH, Niemcy

autor

Lubeck M.

• Bruker Daltonik GmbH, Niemcy

Bibliografia

• 1. Zubarev R.A., Kelleher N.L., McLafferty F.W.: Electron Capture Dissociation of Multiply Charged Protein Cations. A. Nonergodre Process. „J. Am. Chem. Soc.”, 1998, 120, 3265-3266.
• 2. Syka J.E., Coon J.J., Schroeder M.J., Shabanowitz J., Hunt D.F. Peptide and protein sequence analysis by electron transfer dissociation mass spectrometry: „Proc. Natl. Acad. Sci USA”, 2004, 101(26), 9528-9533.
• 3. Hartmer R., Ledertheil T., Brelenfeld A.: Proc. 53rd ASMS Conf. Mass Spectrom. Allied Topic. San Antonio, TX 2005