Clinical database – neonatology

• Autorzy: Sarapata K. , Woźniak J. , Walecki P. , Kieczeń W. , Lauterbach R.

Warianty tytułu

PL

Kliniczne bazy danych – neonatologia

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

This paper presents some aspects of the informatics implementation of the Neonatology Database, which was created in the Department of Bioinformatics and Telemedicine Collegium Medicum Jagiellonian Univ. in association with The Neonatology Clinic. The significance of this database for interdisciplinary collaboration is presented. The database is mainly utilized to gather hospital data in form of accessing and processing. The main assumptions of implementation are: universal code to use it by other clinics' databases, a centralized location of the database server and minimize client computer required. Programming languages (PHP), system server (Linux) and projects (Apache, MySQL, openSSL) are on GNU GPL license.

PL

Praca opisuje wybrane aspekty implementacji bazy danych 'Neonatologia', która była zrealizowana w Zakładzie Bioinformatyki i Telemedycyny Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego we współpracy z Kliniką Neonatologii. Praca stanowi przykład interdyscyplinarnej współpracy podczas realizacji systemu bazodanowego. Kliniczna baza danych przeznaczona jest zasadniczo do zbierania i przechowywania odpowiednio sformatowanych danych, umożliwia do nich dostęp i ich przetwarzanie. Głównym założeniem implementacji jest utworzenie szkieletu programistycznego (framework) systemu bazodanowego w celu ponownego jego wykorzystania na użytek innych klinik. Kolejne założenia głównie dotyczą uwarunkowań ekonomicznych: centralizacja położenia serwera i minimalizacja wymogów klienta-użytkownika systemu, wykorzystane języki programowania (PHP), system serwera (Linux) i serwery usług (Apache, MySQL, openSSL), które są. na licencji GNU GPL.

Słowa kluczowe

EN

medical databases; neonatology; programming languages

PL

medyczna bazy danych; neonatologia; języki programowania

• Wydawca: Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum ; Index Copernicus Sp. z o.o.
• Czasopismo: Bio-Algorithms and Med-Systems
• Rocznik: 2006
• Tom: Vol. 2, no. 4
• Strony: 57--64
• Opis fizyczny: Bibliogr. 36 poz., rys., tab.

Twórcy

autor

Sarapata K.

• Department of Bioinformatics and Telemedicine, Collegium Medicum Jagiellonian University

autor

Woźniak J.

• Clinic of Neonatology, Collegium Medicum Jagiellonian University
• Department of Bioinformatics and Telemedicine, Collegium Medicum Jagiellonian University

autor

Walecki P.

• Department of Bioinformatics and Telemedicine, Collegium Medicum Jagiellonian University

autor

Kieczeń W.

• Department of Bioinformatics and Telemedicine, Collegium Medicum Jagiellonian University
• The Faculty of Physics, Astronomy and Applied Computer Science Jagiellonian University

autor

Lauterbach R.

• Department of Bioinformatics and Telemedicine, Collegium Medicum Jagiellonian University
• Clinic of Neonatology, Collegium Medicum Jagiellonian University

Bibliografia

• Internet sources
• 1. http://www.gnu.org/licenses/gpl.html.
• 2. http://httpd.apache.org/.
• 3. http://www.openssl.org/.
• 4. http://php.net/.
• 5. http://mysql.com/.
• 6. E.F. Codd, A Relational Model of Data for Large Shared Data Banks. Communications of the ACM, June 1970,13(6), 377-387. www.cs.nott.ac.uk/~nza/G51 DBS/codd.pdf
• 7. P.P. Chen, The Entity-Relationship Model - Toward a Unified View of Data. ACM Transactions on Database Systems, 1976, 1(1), 9-36. http://csc.lsu.edu/news/erd.pdf
• 8. http://www.supinfo-projects.com/fr/2005/etapes_merise_en/.
• 9. http://www.php.net/manual/en/ref.pdo.php.
• 10. http://pear.php.net/package/SpreadsheeLExceLWriter.
• 11. http://struts.apache.org/primer.htmltmvc.
• 12. IEEE Std 1363-2000: Standard Specifications for Public Key Cryptography. IEEE, August 2000. http://grouper.ieee.org/groups/1363/P1363
• 13. http://tools.ietf.org/html/rfc3280.
• 14. http://www.giodo.gov.pl/389/.
• 15. http://dev.mysql.eom/doc/refman/5.0/en/stored-procedures.html; http://dev.mysql.com/doc/refman/4.1/en/procedure-analyse.html.
• 16. M. Lenzerini, Data Integration: A Theoretical Perspective. PODS 2002, 243-246.
• 17. http://dev.mysql.eom/doc/refman/5.0/en/lock-tables.html.
• 18. H.G. Hugh Jr., Scientific Method in Practice, Cornell University, New York 2002.
• 19. http://en.php.net/manual/pl/ref.gettext.php.
• 20. 20 http://smarty.php.net/.
• 21. http://eyeos.org/.
• 22. http://mysql.com/products/tools/.
• 23. www.DataMining.DatabaseCorner.com.
• Paper sources
• 24. Walecki P., Sarapata K., Trąbka J., Biologizacja nauk informatycznych, W: Polskie doświadczenia w kształtowaniu społeczeństwa informacyjnego. Dylematy cywilizacyjno-kulturowe, red. L. H. Haber,, Wydział Nauk Społecznych Stosowanych, Akademia Gomiczo-Hutnicza, Krakow 2002, s.191-198
• 25. Pyrczak W., Lasoń W., Sarapata K., Walecki P., Trąbka J., ola spojnosci merytoryczno-formalnej w obiektowym projektowaniu systemdw informatycznych, W: Techniki komputerowe w przekazie edukacyjnym, red. J. Morbitzer, Wydawnictwo Naukowe Akademii Pedagogicznej, Krakow 2001, s. 148-152
• 26. Pyrczak W., Lasoń W., Walecki P., Sarapata K., Trąbka J., Teleinformatyczne systemy w edukacji medycznej, W: Komputer w edukacji, red. J. Morbitzer, Wyd. Naukowe Akademii Pedagogicznej, Kraków 2003, s. 226-230.
• 27. Walecki P., Sarapata K., Trąbka J., Rzeczywistość wirtualna w ujęciu biocybernetycznym, W: Proceedings of the Second International Conference on Philosophy and Computer Science Processes of Evolution in Real and Virtual Systems, Kraków 2002, s. 67-71.
• 28. Sarapata K., Walecki P., Pyrczak W., Lasoń W., Roterman I., Szybiński Z., Medical Database of thyroid cancer, W: E-he@lth in Common Europe, red. K. Zieliński, M. Duplaga, IEEE Kraków 2003, s. 347-354.
• 29. Walecki P., Pyrczak W., Lasoń W., Sarapata K., Roterman-Konieczna I., Klekawka T., Korab-Chrzanowska E., Balwierz W., Skoordynowana baza danych u chorobie Hodgkina (HD) zorientowana na diagnostykę w systemie rozproszonym, Przegląd Lekarski, t. 60, supl. 6, s. 78.
• 30. Walecki P., Lasoń W., Sarapata K., Biologizacja w obrębie nauk technicznych, Krakowskie Studia Małopolskie, 2002, t. 6, s. 313-330.
• 31. Lasoń W., Walecki P., Pyrczak W., Sarapata K., Roterman-Konieczna I, Medycyna Oparta na Dowodach (EBM) – nowe podejście optymalizacyjne wykorzystujące systemy komputerowe, W: Tadeusiewicz R., Ligęza A., Szymkat M. (red): Computer Methods and Systems, 2005: 455^62.
• 32. Martyniak J. (red), Podstawy informatyki z elementami telemedycyny: ćwiczenia dla studentów medycyny, (Walecki P. współautor sześciu rozdziałów), Kraków: Wydaw. Uniwersytetu Jagiellońskiego 2005.
• 33. Walecki P., Sarapata K., Lasoń W., Pyrczak W., Roterman-Konieczna I., Balwierz W., Telemedical Database of Hodgkin Disease, In: Transformation of Healthcare with Information Technologies, Studies in Health Technology and Informatics, IOS Press, Amsterdam-Berlin-Oxford-Tokyo-Washington, DC 2004, s. 51-60.
• 34. Lasoń W., Walecki P., Trąbka J., Telemedyczne bazy danych - teoria i praktyka, W: Społeczeństwo informacyjne wizja czy rzeczywistość? Red. L. Haber, AGH Uczelniane Wydawnictwa Naukowo-Techniczne, Kraków 2004, s. 349-360.
• 35. Sarapata K., Usarz M., Trąbka J., Walecki P., Pyrczak W, Roterman-Konieczna I, Security of net servers in biological approach, Journal of Artificial Intelligence, Vol. 1, No 1(23)/2004, pp. 31-38.
• 36. Lasoń W., Walecki P., Pyrczak W., Sarapata K., Trąbka J., Zintegrowane telemedyczne bazy danych pacjentów z chorobami nowotworowymi, Sztuczna inteligencja - Organizacje wirtualne, red. M. Kłopotek, J. Tchorzewski, Wydawnictwo Akademii Podlaskiej, Siedlce 2003, s. 35-40.