Charakterystyka wybranych metod izolacji i identyfikacji drobnoustrojow w żywności

• Autorzy: Hać-Szymańczuk Elżbieta

Identyfikatory

DOI

10.15199/65.2023.11.3

Warianty tytułu

EN

Characteristics of selected methods of isolation and identification of microorganisms in food

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

PL

Szybkie wykrycie i identyfikacja drobnoustrojów występujących w żywności jest głównym celem dla laboratoriów mikrobiologicznych. W ostatnich latach klasyczne metody analizy mikrobiologicznej są uzupełniane o nowoczesne metody analityczne i molekularne. W niniejszym artykule omówiono następujące metody: fluorescencyjną hybrydyzację in situ (FISH), metody PCR i RT-PCR, spektrometrię masową MALDI-TOF i cytometrię przepływową. Opisano również zasadę działania i dobór podłoży chromogennych służących do wykrywania i identyfikacji drobnoustrojów w produktach spożywczych.

EN

The rapid detection and identification of microorganisms found in food is the main goal for microbiology laboratories. In recent years, classical methods of microbiological analysis have been supplemented with modern analytical and molecular methods. This article discusses the following methods: fluorescence in situ hybridization (FISH), PCR and RT-PCR methods, MALDI-TOF mass spectrometry and flow cytometry. The principle of operation and the selection of chromogenic media for their detection and identification of microorganisms in food products are also described.

Słowa kluczowe

PL

identyfikacja mikroorganizmów; PCR; MALDI-TOF MS; cytometria przepływowa; podłoża chromogenne

EN

identification of microorganisms; PCR; MALDI-TOF MS; flow cytometry; chromogenic microbial substrates

• Wydawca: Wydawnictwo SIGMA-NOT
• Czasopismo: Przemysł Spożywczy
• Rocznik: 2023
• Tom: T. 77, nr 11
• Strony: 24--28
• Opis fizyczny: Bibliogr. 26 poz.

Twórcy

autor

Hać-Szymańczuk Elżbieta

• Instytut Nauk o Żywności, Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Warszawa

• https://orcid.org/0000-0002-2283-153X

Bibliografia

• [1] Adaszek Ł., B. Dzięgiel, Ł. Mazurek, S. Winiarczyk. 2018. „Zastosowanie techniki PCR w badaniach bakteriologicznych”. Życie Weterynaryjne 93 (4) : 234-237.
• [2] Akter L., R. Haque, M.A. Salam. 2014. „Comparative evaluation of chromogenic agar medium and conventional culture system for isolation and presumptive identification of uropathogens”. Pakistan Journal of Medical Science 30 (5) : 1033-1038, DOI: 10.12669%2Fpjms.305.5243.
• [3] AlMasoud N., H. Muhamadali, M. Chisanga, H. AlRabiah, C.A. Limab, R. Goodacre. 2021. „Discrimination of bacteria using whole organism fingerprinting: the utility of modern physicochemical techniques for bacterial typing”. Analyst 146 : 770-788, DOI: 10.1039/d0an01482f.
• [4] Bhagwat A.A. 2003. „Simultaneous detection of Escherichia coli O157:H7, Listeria monocytogenes and Salmonella strains by real-time PCR”. International Journal of Food Microbiology 84 (2) : 217-224, DOI: 10.1016/s0168-1605(02)00481-6.
• [5] Baj J., B. Paterczyk, Ł. Dziewit. 2019. „Metody stosowane w mikrobiologii”. W: Mikrobiologia (pod red. J. Baj), 317-340. Warszawa: Wydawnictwo Naukowe PWN SA.
• [6] Brzychczy-Włoch M., M. Bulanda, D. Ochojska, P.B. Heczko. 2009. „Nowoczesne metody diagnostyki Streptococcus agalactiae”. Postępy Neonatologii 13 (1) : 71-74.
• [7] Bucka-Kolendo J., B. Sokołowska. 2021. „Porównanie metod identyfikacji bakterii Lactobacillus”. ŻYWNOŚĆ. Nauka. Technologia. Jakość 2 (127) : 49-60, DOI: 10.15193/zntj/2021/127/377.
• [8] Bzducha A. 2007. „Szybkie metody identyfikacji mikroorganizmów w żywności”. Medycyna Weterynaryjna 63 (7) : 773–777.
• [9] Canciu A., M. Tertis, O. Hosu, A. Cernat, C. Cristea, F. Graur. 2021. „Modern analytical techniques for detection of bacteria in surface and wastewaters”. Sustainability 13 : 7229, DOI: 10.3390/su13137229.
• [10] Cieślik J., M. Wróblewska. 2018. „MALDI TO F MS – nowe możliwości w diagnostyce mikrobiologicznej”. Diagnostyka Laboratoryjna 54 (2) : 99-104, DOI: 10.5604/01.3001.0013.7693.
• [11] Fournier P.E., M. Drancourt, P. Colson, J.M. Rolain, B. La Scola, D. Raoult. 2013. „Modern clinical microbiology: new challenges and solutions”. Nature Reviews Microbiology 11 (8) : 574-585, DOI: 10.1038/nrmicro3068.
• [12] Jaroszewska E., A. Misiewicz. 2012. „Wybrane molekularne metody identyfikacji mikroorganizmów w kolekcjach kultur drobnoustrojów”. Postępy Nauki i Technologii Przemysłu Rolno-Spożywczego 67 (4) : 67-74.
• [13] Kizerwetter-Świda M., D. Chrobak-Chmiel, M. Rzewuska. 2018. „Problemy weterynaryjnej diagnostyki mikrobiologicznej dotyczącej zakażeń gronkowcowych”. Życie Weterynaryjne 93 (6) : 373-376.
• [14] Lachtara B., K. Wieczorek, J. Osek. 2016. „Molekularne metody wykrywania Listeria monocytogenes w żywności”. Medycyna Weterynaryjna 72 (1) : 12-17.
• [15] Łyszcz M., A. Gałązka. 2017. „Metody oparte o amplifikację DNA techniką PCR wykorzystywane w ocenie bioróżnorodności mikroorganizmów glebowych”. KOSMOS 315 (2) : 193-206.
• [16] Marciniak M., M. Robak. 2012. „PCR jako narzędzie do identyfikacji i różnicowania drobnoustrojów.” Acta Scientiarum Polonorum, Biotechnologia 11 (2) : 5-16.
• [17] Mikołajczyk A., E. Stefaniuk, K. Bosacka, W. Hryniewicz. 2016. „Właściwości i zastosowanie podłoży bakteriologicznych”. Postępy Mikrobiologii 55 (3) : 320-329.
• [18] Misiewicz A., A. Goncerzewicz. 2013. „Wykrywanie bakterii Salmonella metodami molekularnymi w produktach żywnościowych”. Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych 573 : 3-11.
• [19] Mobed A., B. Baradaran, M.d.l. Guardia, M. Agazadeh, M. Hasanzadeh, M.A. Rezaee, J. Mosafer, A. Mokhtarzadeh, M.R. Hamblin. 2019. „Advances in detection of fastidious bacteria: from microscopic observation to molecular biosensors”. Trends in Analytical Chemistry 113 (4) : 157-171, DOI: 10.1016/j.trac.2019.02.012.
• [20] Olszewska M., Ł. Łaniewska-Trokenheim. 2011. „Badania stanu „niehodowalności” komórek bakterii fermentacji mlekowej w niesprzyjających warunkach rozwoju”. Medycyna Weterynaryjna 67 (2) : 105-109.
• [21] Olszewska M.A., A.M. Kocot, Ł. Łaniewska-Trokenheim. 2016. „Analiza cytometryczna w mikrobiologicznych badaniach żywności”. Medycyna Weterynaryjna 72 (3) : 162-167.
• [22] Perry J.D., A.M. Freydiere. 2007. „The application of chromogenic media in clinical microbiology. Journal of Applied Microbiology 30 (5) : 2046-2055, DOI: 10.1111/j.1365-2672.2007.03442.x.
• [23] Szczepańska E., M. Robak. 2013. „Proteomika w badaniu drobnoustrojów”. Acta Scientiarum Polonorum, Biotechnologia 12 (4) : 25-40.
• [24] Trojanowska K., J. Baumgart, Z. Libudzisz, K. Czaczyk, E. Ołtuszak, J. Polak, M. Szczęsna, E. Tomczak, M. Wiewiórowska, A. Sip, D. Walkowiak-Tomczak. 2003. „Zastosowanie szybkich metod mikrobiologicznych i sond genetycznych w analizie żywności”. W: Metody pomiarów i kontroli jakości w przemyśle spożywczym i biotechnologii (pod red. M. Jankiewicza i Z. Kędziora), 325-408. Poznań: Wydawnictwo Akademii Rolniczej im. Augusta Cieszkowskiego w Poznaniu.
• [25] Zadernowska A., W. Chajęcka-Wierzchowska, L. Kłębukowska. 2014. „Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ jako alternatywna metoda oznaczania obecności pałeczek Salmonella sp. w mięsie drobiowym”. ŻYWNOŚĆ. Nauka. Technologia. Jakość 92 (1) : 92-102, DOI: 10.15193/zntj/2014/92/092-102.
• [26] Żabicka D., E. Literacka. 2013. „Nowoczesne metody wykrywania i identyfikacji bakterii”. Forum Zakażeń 4 (1) : 65-72.

Uwagi

Opracowanie rekordu ze środków MNiSW, umowa nr SONP/SP/546092/2022 w ramach programu "Społeczna odpowiedzialność nauki" - moduł: Popularyzacja nauki i promocja sportu (2024).