Distributed mesh generation for objects with shape variability

• Autorzy: Poławski B. , Sawicki B.

Identyfikatory

DOI

10.15199/48.2017.12.36

Warianty tytułu

PL

Rozproszone generowanie siatek dla obiektów o zmiennych kształtach

• Języki publikacji: EN

Abstrakty

EN

The article presents an efficient way to generate a large number of finite element meshes to support statistical analysis of simulation of electromagnetic field inside biological objects which are characterized by a strong shape variability. Demonstrated solution uses capabilities of modern distributed computer systems and open source software. Parametric model of a hen egg has been used as a simple biological object to test the developed solution.

PL

Praca przedstawia efektywną metodę generowania wielu siatek elementów skończonych dla potrzeb modelowania pola elektromagnetycznego w obiektach o pochodzeniu biologicznym charakteryzujących się dużą zmiennością kształtu i ich statystycznej analizy. Do rozwiązania problemu zostały wykorzystane możliwości nowoczesnych systemów informatycznych o architekturze rozproszonej i otwartozródłowego oprogramowania. Do celów testów zaproponowanego rozwiązania został stworzony parametryczny model kurzego jaja jako przykład prostego obiektu biologicznego.

Słowa kluczowe

EN

meshing; HPC; distributed computing; variability; parameter sweeping

PL

generowanie siatki; HPC; obliczenia rozproszone; analiza zmienności

• Wydawca: Wydawnictwo SIGMA-NOT
• Czasopismo: Przegląd Elektrotechniczny
• Rocznik: 2017
• Tom: R. 93, nr 12
• Strony: 143--146
• Opis fizyczny: Bibliogr. 10 poz., rys.

Twórcy

autor

Poławski B.

• Institute of Theory of Electrical Engineering, Measurement and Information Systems, Faculty of Electrical Engineering, Warsaw University of Technology, ul. Koszykowa 75, 00-662 Warszawa, Poland

autor

Sawicki B.

• Institute of Theory of Electrical Engineering, Measurement and Information Systems, Faculty of Electrical Engineering, Warsaw University of Technology, ul. Koszykowa 75, 00-662 Warszawa, Poland

Bibliografia

• [1] M. Borysiak, Z. Krawczyk, J. Starzynski, R. Szmurło, S. Wincenciak: CUDA accelerated finite element mesh morpher. Przegląd Elektrotechniczny. R. 81, 2011
• [2] Ivana Despotovic, Bart Goossens, Wilfried Philips: MRI Segmentation of the Human Brain: Challenges, Methods, and Applications, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 23 pages, 2015.
• [3] J. Higgins, V. Holmes, and C. Venters: Orchestrating Docker Containers in the HPC Environment, ISC High Performance, 2015, Germany
• [4] Krupa, Artur, Bartosz Sawicki Massive Simulations Using MapReduce Model, Informatyka, Automatyka, Pomiary w Gospodarce i Ochronie Środowiska, 2015. Vol. 5, p. 45–47
• [5] Andreas Pommert, Karl Heinz Höhne, Bernhard Pflesser, Ernst Richter, Martin Riemer, Thomas Schiemann, Rainer Schubert, Udo Schumacher, Ulf Tiede: Creating a highresolution spatial/symbolic model of the inner organs based on the Visible Human, In Medical Image Analysis, Volume 5, Issue 3, 2001
• [6] Bartosz Sawicki: Uncertainty of numerical simulations in bioelectromagnetic problems, Przegląd Elektrotechniczny, R. 91, Nr 7/2015, pp. 49-51
• [7] Martin Styner, Guido Gerig: Three-dimensional medial shape representation incorporating object variability, Proceedings of the 2001 IEEE Computer Society Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR),
• [8] Tuomas Tallinen, Jun Young Chung, François Rousseau, Nadine Girard, Julien Lefèvre, L.Mahadevan: On the growth and form of cortical convolutions, Nature Physics, 2016.
• [9] O. Tange: GNU Parallel - The Command-Line Power Tool, login: The USENIX Magazine, pp. 42-47, February 2011
• [10] Nobuo Yamamoto: Equation of Egg Shaped Curve, http://www.geocities.jp/nyjp07/index_egg_E.html#3 (access: 2017-10-20)

Uwagi

Opracowanie ze środków MNiSW w ramach umowy 812/P-DUN/2016 na działalność upowszechniającą naukę (zadania 2017).