PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
Czasopismo
2009 | 7 | 3 | 607-613
Tytuł artykułu

Two-dimensional diffusion model for the biopolymers dynamics at nanometer scale

Autorzy
Treść / Zawartość
Warianty tytułu
Języki publikacji
EN
Abstrakty
EN
In this paper the driven transport of linear polymers through a nanopore is presented. Biopolymer physical behavior in an external electric field is modeled and its motion is simulated using the Langevin impulse integrator method. Within fairly large limits, the polymer translocation time is inversely proportional with the electric field intensity and directly proportional with the polymer chain length.
Wydawca

Czasopismo
Rocznik
Tom
7
Numer
3
Strony
607-613
Opis fizyczny
Daty
wydano
2009-09-01
online
2009-06-25
Twórcy
autor
  • Faculty of Applied Sciences, Physics Department I, “Politehnica” University of Bucharest, 313 Splaiul Independentei Street, 060042, Bucharest, Romania, paun@physics.pub.ro
Bibliografia
  • [1] J. J. Kasianowiczs, E. Brandin, D. Branton, D. W. Deaner, P. Natl. Acad. Sci. USA 93, 13770 (1996) http://dx.doi.org/10.1073/pnas.93.24.13770[Crossref]
  • [2] M. Bates, M. Burns, A. Meller, Biophys. J. 84, 2366 (2003) http://dx.doi.org/10.1016/S0006-3495(03)75042-5[Crossref]
  • [3] E. Slonkina, A. B. Kolomeisky, J. Chem. Phys., 118, 15, 7112 (2003) http://dx.doi.org/10.1063/1.1560932[Crossref]
  • [4] A. Meller, J. Phys.-Condens. Mat. 15, R581 (2003) http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/15/17/202[Crossref]
  • [5] K. F. Luo, T. Ala-Nissila, A. Bhattacharya, Phys. Rev. Lett. 99, 148102 (2007) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.99.148102[Crossref]
  • [6] K. F. Luo, I. Huopaniemi, T. Ala-Nissila, S. C. Ying, J. Chem. Phys. 124, 114704 (2006) http://dx.doi.org/10.1063/1.2179792[Crossref]
  • [7] R. D. Skeel, J. Izaguirre, Mol. Phys., 100, 3885 (2002) http://dx.doi.org/10.1080/0026897021000018321[Crossref]
  • [8] G. Bussi, M. Parrinello, Phys. Rev. E 75, 056707 (2007) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.75.056707[Crossref]
  • [9] S. Matysiak, A. Montesi, M. Pasquali, A. B. Kolomeisky, C. Clementi, Phys. Rev. Lett. 96, 118103 (2006) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.96.118103[Crossref]
  • [10] J. J. Semler, J. Genzer, J. Chem. Phys. 119, 5274 (2003) http://dx.doi.org/10.1063/1.1597872[Crossref]
  • [11] V.-P. Paun, Mater. Plast. 44, 393 (2007)
  • [12] C.-M. Chen, Physica A 350, 95 (2005) http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2004.11.026[Crossref]
  • [13] J. Chuang, Y. Kantor, M. Kardar, Phys. Rev. E 65, 011802 (2002) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.65.011802[Crossref]
  • [14] A. Meller, J. Phys.-Condens. Mat. 15, R581 (2003) http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/15/17/202[Crossref]
  • [15] J. B. Heng et al., Biophys. J. 87, 2905 (2004) http://dx.doi.org/10.1529/biophysj.104.041814[Crossref]
  • [16] I. Huopaniemi, K. F. Luo, T. Ala-Nissila, S. C. Ying, J. Chem. Phys. 125, 124901 (2006) http://dx.doi.org/10.1063/1.2357118[Crossref]
  • [17] L. Brun et al., Phys. Rev. Lett. 100, 158302 (2008) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.100.158302[Crossref]
  • [18] R. J. Murphyand, M. Muthukumar, J. Chem. Phys. 126, 051101 (2007) http://dx.doi.org/10.1063/1.2435717[Crossref]
  • [19] D. Fologea, J. Uplinger, B. Thomas, D. S. Mcnabband, J. Li, Nano Lett. 5, 1734 (2005) http://dx.doi.org/10.1021/nl051063o[Crossref]
  • [20] V.-P. Paun, Mater. Plast. 45, 57 (2008)
  • [21] A. Meller, D. Branton, Electrophoresis 23, 2583 (2002) http://dx.doi.org/10.1002/1522-2683(200208)23:16<2583::AID-ELPS2583>3.0.CO;2-H[Crossref]
  • [22] V.-P. Paun, Mater. Plast. 43, 57 (2006)
  • [23] A. Meller, L. Nivon, D. Branton, Phys. Rev. Lett. 86, 3435 (2001) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.86.3435[Crossref]
  • [24] A. J. Storm et al., Nano Lett. 5, 1193 (2005) http://dx.doi.org/10.1021/nl048030d[Crossref]
  • [25] K. F. Luo, T. Ala-Nissila, S. C. Ying, A. Bhattacharya, Phys. Rev. Lett. 100, 058101 (2008) http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.100.058101[Crossref]
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikatory
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.-psjd-doi-10_2478_s11534-009-0087-8
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.