Nowa wersja platformy, zawierająca wyłącznie zasoby pełnotekstowe, jest już dostępna.
Przejdź na https://bibliotekanauki.pl

PL EN


Preferencje help
Widoczny [Schowaj] Abstrakt
Liczba wyników
Czasopismo
2012 | 10 | 6 | 1791-1798
Tytuł artykułu

Spatial relationships between the pharmacophores of endomorphin-2: a comparative study of stereoisomers

Autorzy
Treść / Zawartość
Warianty tytułu
Języki publikacji
EN
Abstrakty
EN
The spatial relationships between the pharmacophore elements were investigated in the case of four different stereoisomeric forms of opioid tetrapeptide, endomorphin-2, taking into account the L-D and cis-trans isomerisms. On the basis of distances and angles measured between the pharmacophoric points, a comparative analysis of conformational distributions was performed, applying a variety of distance-angle maps. The results obtained by this theoretical study indicated that the stereoisomers of endomorphin-2 could be distinguished from one another, based on the comparative analysis of distance-angle maps. Nevertheless, it could be concluded that this method proved to be suitable to examine the effects of L-D and cis-trans isomerisms on the spatial relationships of the pharmacophores of tetrapeptide. [...]
Wydawca

Czasopismo
Rocznik
Tom
10
Numer
6
Strony
1791-1798
Opis fizyczny
Daty
wydano
2012-12-01
online
2012-09-21
Twórcy
  • Institute of Biophysics, Biological Research Centre, Hungarian Academy of Sciences, H-6726, Szeged, Hungary, leitgeb@brc.hu
Bibliografia
  • [1] J.E. Zadina, L. Hackler, L.-J. Ge, A.J. Kastin, Nature 386, 499 (1997) http://dx.doi.org/10.1038/386499a0[Crossref]
  • [2] B. Leitgeb, Chem. Biodiv. 4, 2703 (2007) http://dx.doi.org/10.1002/cbdv.200790221[Crossref]
  • [3] B. Leitgeb, F. Ötvös, G. Tóth, Biopolymers 68, 497 (2003) http://dx.doi.org/10.1002/bip.10333[Crossref]
  • [4] B. Leitgeb, A. Szekeres, G. Tóth, J. Pept. Res. 62, 145 (2003) http://dx.doi.org/10.1034/j.1399-3011.2003.00084.x[Crossref]
  • [5] B. Leitgeb, A. Szekeres, J. Mol. Struct. - THEOCHEM 666–667, 337 (2003) http://dx.doi.org/10.1016/j.theochem.2003.08.043[Crossref]
  • [6] B. Leitgeb, G. Tóth, Eur. J. Med. Chem. 40, 674 (2005) http://dx.doi.org/10.1016/j.ejmech.2004.10.015[Crossref]
  • [7] B. Leitgeb, Chem. Biol. Drug Des. 79, 313 (2012) http://dx.doi.org/10.1111/j.1747-0285.2011.01275.x[Crossref]
  • [8] D. Bernard, A. Coop, A.D. MacKerell Jr, J. Am. Chem. Soc. 125, 3101 (2003) http://dx.doi.org/10.1021/ja027644m[Crossref]
  • [9] D. Bernard, A. Coop, A.D. MacKerell Jr, J. Med. Chem. 48, 7773 (2005) http://dx.doi.org/10.1021/jm050785p[Crossref]
  • [10] D. Bernard, A. Coop, A.D. MacKerell Jr, J. Med. Chem. 50, 1799 (2007) http://dx.doi.org/10.1021/jm0612463[Crossref]
  • [11] D.A. Case, T.A. Darden, T.E. Cheatham III, C.L. Simmerling, J. Wang, R.E. Duke, R. Luo, K.M. Merz, D.A. Pearlman, M. Crowley, R.C. Walker, W. Zhang, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, K.F. Wong, F. Paesani, X. Wu, S. Brozell, V. Tsui, H. Gohlke, L. Yang, C. Tan, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, P. Beroza, D.H. Mathews, C. Schafmeister, W.S. Ross, P.A. Kollman, AMBER 9 (University of California, San Francisco, 2006)
  • [12] V. Hornak, R. Abel, A. Okur, B. Strockbine, A. Roitberg, C. Simmerling, Proteins 65, 712 (2006) http://dx.doi.org/10.1002/prot.21123[Crossref]
  • [13] G.D. Hawkins, C.J. Cramer, D.G. Truhlar, Chem. Phys. Lett. 246, 122 (1995) http://dx.doi.org/10.1016/0009-2614(95)01082-K[Crossref]
  • [14] G.D. Hawkins, C.J. Cramer, D.G. Truhlar, J. Phys. Chem. 100, 19824 (1996) http://dx.doi.org/10.1021/jp961710n[Crossref]
  • [15] V. Tsui, D.A. Case, Biopolymers (Nucl. Acid Sci.) 56, 275 (2001) http://dx.doi.org/10.1002/1097-0282(2000)56:4<275::AID-BIP10024>3.0.CO;2-E[Crossref]
  • [16] D. Pal, P. Chakrabarti, J. Biomol. Struct. Dyn. 18, 273 (2000) http://dx.doi.org/10.1080/07391102.2000.10506665[Crossref]
  • [17] P. Chakrabarti, D. Pal, Prog. Biophys. Mol. Biol. 76, 1 (2001) http://dx.doi.org/10.1016/S0079-6107(01)00005-0[Crossref]
Typ dokumentu
Bibliografia
Identyfikatory
Identyfikator YADDA
bwmeta1.element.-psjd-doi-10_2478_s11532-012-0105-3
JavaScript jest wyłączony w Twojej przeglądarce internetowej. Włącz go, a następnie odśwież stronę, aby móc w pełni z niej korzystać.