Wyniki wyszukiwania - BazTech

1

Wprowadzenie do technologii mikromacierzy DNA

Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2004

|

R. 9, nr 1

18-20

PL

Pierwotnie badania wzoru ekspresji genów polegały na praco- i czasochłonnej analizie pojedynczych genów. Wprowadzenie technologii mikromacierzy DNA umożliwiło badanie całego genomu danego organizmu na chipie wielkości szkiełka mikroskopowego.

2

University of Kuopio oczami Polaków

Skommer J., Włodkowic D.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2004

|

R. 9, nr 2

8-9

3

Projektowanie eksperymentu z wykorzystaniem mikromacierzy DNA

Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2004

|

R. 9, nr 2

15-17

PL

Właściwe zaplanowanie eksperymentu, w którym pragniemy wykorzystać technikę mikromacierzy, jest etapem kluczowym dla osiągnięcia sukcesu, tzn. dla uzyskania wyników wiarygodnych, możliwych do opublikowania oraz sprawdzenia, powtórzenia i dalszego wykorzystania przez następnych eksperymentatorów. Technika mikromacierzy wciąż należy do jednej z droższych w dziedzinie biologii molekularnej, co zdecydowanie wpływa na niektóre elementy eksperymentu, jak ilość powtórzeń i prób kontrolnych. Istotnym etapem w analizie ekspresji genów (jako najczęstsze, choć oczywiście nie jedyne zastosowanie mikromacierzy DNA) są analizy statystyczne i bioinformatyczne.

4

Wybrane metody szacowania genotoksyczności

Skommer J., Włodkowic D.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2003

|

R. 8, nr 5

16-19

5

Systemy znakowania fluorescencyjnego w real-timie PCR. Cz. 2

Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2003

|

R. 8, nr 4

34-36

PL

Część I artykułu (LAB 3/2003) "Systemy detekcji w real-timie PCR" przybliżyła czytelnikowi podstawy techniki real-time PCR, rodzaje stosowanych fluoroforów oraz kilka bardzo popularnych systemów znakowania, jak SYBR Green, TaqMan oraz Hyb Probe. W niniejszym opracowaniu skupię się na omówieniu kolejnych systemów, m. in. Molecular Beacons i Scorpions.

6

Systemy znakowania fluorescencyjnego w real-timie PCR. Cz. 1

Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2003

|

R. 8, nr 3

6-8

PL

Technika PCR zrewolucjonizowała technologię detekcji i pracy z kwasami nukleinowymi. Tradycyjny PCR (czy RT-PCR; RT - ang. reverse transcription, reakcja odwrotnej transkrypcji) z detekcją kwasów nukleinowych na etapie końcowym (w fazie plateau) rozwinął się w technologię umożliwiającą przeprowadzenie takiej detekcji w trakcie trwania procesu (faza logarytmiczna) - real-time PCR (kinetyczny PCR).

7

Podstawy analizy matematycznej w ocenie ekspresji genów metodą real-time PCR

Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2003

|

R. 8, nr 6

16-17

PL

Artykuły pt. "Systemy znakowania w real-time PCR" cz. I i II, opublikowane w numerach 3 i 4/2003 LAB, stanowiły, wraz z krótkim wprowadzeniem, dość obszerny przegląd różnych metod detekcji amplikonu w technice real-time PCR. Systemy znakowania mają na celu umożliwienie badaczowi śledzenia reakcji amplifikacji w czasie rzeczywistym, a także - w różnym zakresie - określenia charakterystyki specyficzności reakcji. Uzyskane wyniki, w postaci wartości CT i CP (w praktyce oba parametry stanowią numer cyklu reakcji, przy którym sygnał fluorescencji przekracza poziom tła), stanowią podstawę dalszej analizy, prowadzącej do ilościowego określenia ekspresji badanych genów.

8

Mikromacierze DNA w przemyśle farmaceutycznym - rewolucyjna technologia

Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2003

|

R. 8, nr 5

20-22

PL

Istnieje kilka rodzajów mikromacierzy DNA. Zawierają one na niewielkim obszarze tysiące sond o różnych sekwencjach, umieszczonych w określonym miejscu na powierzchni płytki. Sondy mogą być syntetycznymi oligonukleotydami lub innymi krótkimi cząsteczkami DNA, jak komplementarny DNA (cDNA). Mogą być stosowane do poszukiwania polimorfizmów genetycznych, porównywania RNA izolowanego z różnych komórek (tkanek) i badania ekspresji genów, w sekwencjonowaniu DNA czy detekcji patogenów, a także w badaniach toksykologicznych i poszukiwaniu (testowaniu) nowych środków terapeutycznych.

9

Metody separacji komórek immunologicznie czynnych z płynów ustrojowych

Włodkowic D., Skommer J.

LAB Laboratoria, Aparatura, Badania

|

2003

|

R. 8, nr 2

20-23

PL

Detekcja i analiza funkcji komórek immunologicznie czynnych stała się jednym z ważnych aspektów współczesnej immunodiagnostyki klinicznej. Uzyskanie wiarygodnych wyników przez izolację możliwie czystej populacji określonych typów komórek warunkowane jest doborem odpowiednich technik, zapewniających czułość i selektywność przeprowadzanej izolacji. Odseparowanie określonych komórek jest wstępem do ich oceny czynnościowej, takiej jak testy cytotoksyczności komórkowej, testy proliferacji czy testy migracji.